MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 50757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_013124	ACGA	2	8	2120456	2120463	50 %	0 %	25 %	25 %	256372754
50002	NC_013124	CGTGCG	2	12	2120471	2120482	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256372754
50003	NC_013124	CGA	2	6	2120500	2120505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372754
50004	NC_013124	CGA	2	6	2120605	2120610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372754
50005	NC_013124	TCG	2	6	2120643	2120648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372754
50006	NC_013124	CG	3	6	2120647	2120652	0 %	0 %	50 %	50 %	256372754
50007	NC_013124	CGA	2	6	2120734	2120739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372754
50008	NC_013124	TGGC	2	8	2120752	2120759	0 %	25 %	50 %	25 %	256372754
50009	NC_013124	CGT	2	6	2120767	2120772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372754
50010	NC_013124	GCC	2	6	2120909	2120914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372755
50011	NC_013124	CACG	2	8	2120926	2120933	25 %	0 %	25 %	50 %	256372755
50012	NC_013124	GGT	2	6	2120974	2120979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372755
50013	NC_013124	CAC	2	6	2121076	2121081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372755
50014	NC_013124	TCC	2	6	2121102	2121107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372755
50015	NC_013124	ACG	2	6	2121125	2121130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50016	NC_013124	GCC	2	6	2121138	2121143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372755
50017	NC_013124	GTC	2	6	2121155	2121160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50018	NC_013124	CCG	2	6	2121162	2121167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372755
50019	NC_013124	GC	3	6	2121181	2121186	0 %	0 %	50 %	50 %	256372755
50020	NC_013124	CGC	3	9	2121184	2121192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372755
50021	NC_013124	CGA	2	6	2121232	2121237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50022	NC_013124	GAG	2	6	2121265	2121270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372755
50023	NC_013124	GC	3	6	2121289	2121294	0 %	0 %	50 %	50 %	256372755
50024	NC_013124	GCTG	2	8	2121322	2121329	0 %	25 %	50 %	25 %	256372755
50025	NC_013124	CGA	2	6	2121340	2121345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50026	NC_013124	CT	4	8	2121347	2121354	0 %	50 %	0 %	50 %	256372755
50027	NC_013124	CGA	2	6	2121402	2121407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50028	NC_013124	CTC	2	6	2121410	2121415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372755
50029	NC_013124	CTTC	2	8	2121451	2121458	0 %	50 %	0 %	50 %	256372755
50030	NC_013124	GCTCC	2	10	2121460	2121469	0 %	20 %	20 %	60 %	256372755
50031	NC_013124	GAG	2	6	2121478	2121483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372755
50032	NC_013124	GGC	2	6	2121514	2121519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372755
50033	NC_013124	CG	3	6	2121554	2121559	0 %	0 %	50 %	50 %	256372755
50034	NC_013124	ACG	2	6	2121611	2121616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372755
50035	NC_013124	CCA	2	6	2121640	2121645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372756
50036	NC_013124	CGA	2	6	2121654	2121659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50037	NC_013124	GCT	2	6	2121702	2121707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50038	NC_013124	CGA	2	6	2121708	2121713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50039	NC_013124	ACG	2	6	2121737	2121742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50040	NC_013124	GCGG	2	8	2121814	2121821	0 %	0 %	75 %	25 %	256372756
50041	NC_013124	TGG	4	12	2121838	2121849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372756
50042	NC_013124	CGAG	2	8	2121866	2121873	25 %	0 %	50 %	25 %	256372756
50043	NC_013124	TCG	2	6	2121878	2121883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50044	NC_013124	ACG	2	6	2121911	2121916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50045	NC_013124	GC	3	6	2122037	2122042	0 %	0 %	50 %	50 %	256372756
50046	NC_013124	CGGC	2	8	2122043	2122050	0 %	0 %	50 %	50 %	256372756
50047	NC_013124	TCG	2	6	2122052	2122057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50048	NC_013124	CTC	2	6	2122090	2122095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372756
50049	NC_013124	TGC	2	6	2122232	2122237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50050	NC_013124	CGT	3	9	2122245	2122253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50051	NC_013124	GCA	2	6	2122267	2122272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372756
50052	NC_013124	GCTGAC	2	12	2122299	2122310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50053	NC_013124	CGT	2	6	2122311	2122316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50054	NC_013124	ACGGTG	2	12	2122411	2122422	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256372757
50055	NC_013124	ACC	3	9	2122548	2122556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372757
50056	NC_013124	CCA	2	6	2122557	2122562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372757
50057	NC_013124	CGT	2	6	2122623	2122628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50058	NC_013124	CGA	2	6	2122650	2122655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50065	NC_013124	CGG	2	6	2123019	2123024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372757
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50070	NC_013124	GTT	2	6	2123160	2123165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372757
50071	NC_013124	GCT	2	6	2123240	2123245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50072	NC_013124	GTG	2	6	2123257	2123262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372757
50073	NC_013124	ATC	2	6	2123293	2123298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372757
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50075	NC_013124	TGACGT	2	12	2123444	2123455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256372757
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50082	NC_013124	GTT	2	6	2123826	2123831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372757
50083	NC_013124	AGT	2	6	2123846	2123851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372757
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50085	NC_013124	CGA	2	6	2123997	2124002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50086	NC_013124	GTC	2	6	2124004	2124009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50087	NC_013124	GAG	2	6	2124019	2124024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372757
50088	NC_013124	TCG	2	6	2124041	2124046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50089	NC_013124	GGT	2	6	2124057	2124062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372757
50090	NC_013124	CTG	2	6	2124183	2124188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50098	NC_013124	TCG	2	6	2124664	2124669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50099	NC_013124	CGT	2	6	2124732	2124737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50101	NC_013124	GCACC	2	10	2124767	2124776	20 %	0 %	20 %	60 %	256372757
50102	NC_013124	CTG	3	9	2124795	2124803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50103	NC_013124	GCC	2	6	2124870	2124875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372757
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50105	NC_013124	CGA	2	6	2124935	2124940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50106	NC_013124	CGA	2	6	2125001	2125006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50109	NC_013124	TGCC	2	8	2125145	2125152	0 %	25 %	25 %	50 %	256372757
50110	NC_013124	CGA	2	6	2125166	2125171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50111	NC_013124	CAC	2	6	2125173	2125178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372757
50112	NC_013124	CG	3	6	2125194	2125199	0 %	0 %	50 %	50 %	256372757
50113	NC_013124	GAG	2	6	2125209	2125214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372757
50114	NC_013124	CTG	2	6	2125215	2125220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50115	NC_013124	CCG	2	6	2125270	2125275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372757
50116	NC_013124	GGC	2	6	2125356	2125361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372757
50117	NC_013124	CTG	2	6	2125362	2125367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50118	NC_013124	GAT	2	6	2125461	2125466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372757
50119	NC_013124	CGA	2	6	2125487	2125492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50121	NC_013124	ACGG	2	8	2125578	2125585	25 %	0 %	50 %	25 %	256372757
50122	NC_013124	CGA	2	6	2125613	2125618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
50123	NC_013124	CGA	2	6	2125730	2125735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372757
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50132	NC_013124	GCG	2	6	2126326	2126331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372758
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50141	NC_013124	GCA	2	6	2126584	2126589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372758
50142	NC_013124	GTA	2	6	2126640	2126645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372758
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50144	NC_013124	CGCC	2	8	2126699	2126706	0 %	0 %	25 %	75 %	256372758
50145	NC_013124	AG	3	6	2126763	2126768	50 %	0 %	50 %	0 %	256372758
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50228	NC_013124	GGA	2	6	2131233	2131238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372763
50229	NC_013124	CCG	2	6	2131292	2131297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372763
50230	NC_013124	TCG	2	6	2131370	2131375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372763
50231	NC_013124	ACCC	2	8	2131436	2131443	25 %	0 %	0 %	75 %	256372763
50232	NC_013124	TGG	2	6	2131450	2131455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372763
50233	NC_013124	GC	3	6	2131488	2131493	0 %	0 %	50 %	50 %	256372763
50234	NC_013124	CGA	2	6	2131500	2131505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372763
50235	NC_013124	CCT	2	6	2131599	2131604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372763
50236	NC_013124	CCG	2	6	2131670	2131675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372763
50237	NC_013124	CGTG	2	8	2131713	2131720	0 %	25 %	50 %	25 %	256372763
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50239	NC_013124	GCC	2	6	2131785	2131790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372763
50240	NC_013124	TGCG	2	8	2131822	2131829	0 %	25 %	50 %	25 %	256372763
50241	NC_013124	ACG	2	6	2131831	2131836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372763
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50244	NC_013124	TCG	2	6	2131958	2131963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372763
50245	NC_013124	CGGAG	2	10	2131965	2131974	20 %	0 %	60 %	20 %	256372763
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50249	NC_013124	TGG	2	6	2132155	2132160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372763
50250	NC_013124	CGAC	2	8	2132166	2132173	25 %	0 %	25 %	50 %	256372763
50251	NC_013124	TCGA	2	8	2132225	2132232	25 %	25 %	25 %	25 %	256372763
50252	NC_013124	CTC	2	6	2132281	2132286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372763
50253	NC_013124	CGT	2	6	2133091	2133096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372764
50254	NC_013124	GAC	2	6	2133113	2133118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372764
50255	NC_013124	CGA	2	6	2133192	2133197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372764
50256	NC_013124	AGCC	2	8	2133212	2133219	25 %	0 %	25 %	50 %	256372764
50257	NC_013124	TGT	2	6	2133243	2133248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372764
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50259	NC_013124	GAG	2	6	2133286	2133291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372764
50260	NC_013124	CTG	2	6	2133301	2133306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372764
50261	NC_013124	TCG	2	6	2133320	2133325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372764
50262	NC_013124	ACC	2	6	2133512	2133517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372764
50263	NC_013124	TCGA	2	8	2133527	2133534	25 %	25 %	25 %	25 %	256372764
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50265	NC_013124	AAG	2	6	2133587	2133592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372764
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50267	NC_013124	CTT	2	6	2133712	2133717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256372764
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50272	NC_013124	G	6	6	2133898	2133903	0 %	0 %	100 %	0 %	256372764
50273	NC_013124	CGA	2	6	2133933	2133938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372764
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50276	NC_013124	GCC	2	6	2134140	2134145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372765
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50278	NC_013124	CTGGCC	2	12	2134215	2134226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256372765
50279	NC_013124	GAG	2	6	2134227	2134232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256372765
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50283	NC_013124	CGG	2	6	2134423	2134428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372766
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50291	NC_013124	CCTC	2	8	2134726	2134733	0 %	25 %	0 %	75 %	256372767
50292	NC_013124	CGC	2	6	2134861	2134866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372767
50293	NC_013124	CGG	2	6	2134875	2134880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372767
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50298	NC_013124	CGG	2	6	2135513	2135518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372768
50299	NC_013124	GAC	2	6	2135571	2135576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372768
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50301	NC_013124	CG	3	6	2135749	2135754	0 %	0 %	50 %	50 %	256372768
50302	NC_013124	ACC	2	6	2135776	2135781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256372768
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50309	NC_013124	CA	3	6	2136153	2136158	50 %	0 %	0 %	50 %	256372769
50310	NC_013124	CGA	2	6	2136168	2136173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372769
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50317	NC_013124	CTC	2	6	2137478	2137483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372770
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50321	NC_013124	C	6	6	2137662	2137667	0 %	0 %	0 %	100 %	256372771
50322	NC_013124	CGA	2	6	2137749	2137754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
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50325	NC_013124	GA	3	6	2137940	2137945	50 %	0 %	50 %	0 %	256372771
50326	NC_013124	GAT	2	6	2137957	2137962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
50327	NC_013124	CGA	2	6	2137992	2137997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
50328	NC_013124	CGA	2	6	2138022	2138027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256372771
50329	NC_013124	CGG	2	6	2138047	2138052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256372771
50330	NC_013124	TGA	2	6	2138109	2138114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
50331	NC_013124	TCG	2	6	2138174	2138179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372771
50332	NC_013124	TCC	2	6	2138210	2138215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372771
50333	NC_013124	CTC	2	6	2138254	2138259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256372771
50334	NC_013124	GTA	2	6	2138263	2138268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
50335	NC_013124	TGT	2	6	2138313	2138318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256372771
50336	NC_013124	TC	3	6	2138388	2138393	0 %	50 %	0 %	50 %	256372771
50337	NC_013124	GTA	2	6	2138467	2138472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
50338	NC_013124	GTG	2	6	2138479	2138484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372771
50339	NC_013124	GAT	2	6	2138494	2138499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256372771
50340	NC_013124	CA	4	8	2138502	2138509	50 %	0 %	0 %	50 %	256372771
50341	NC_013124	CAT	2	6	2138515	2138520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256372771
50342	NC_013124	GC	3	6	2138575	2138580	0 %	0 %	50 %	50 %	256372772
50343	NC_013124	CATC	2	8	2138604	2138611	25 %	25 %	0 %	50 %	256372772
50344	NC_013124	GCC	2	6	2138619	2138624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256372772
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50348	NC_013124	CG	3	6	2138684	2138689	0 %	0 %	50 %	50 %	256372772
50349	NC_013124	TCGCG	2	10	2138828	2138837	0 %	20 %	40 %	40 %	256372772
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50460	NC_013124	GAA	2	6	2144025	2144030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256372776
50461	NC_013124	TGG	2	6	2144094	2144099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256372777
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50464	NC_013124	TGC	2	6	2144244	2144249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256372777
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